La elección del Mejor Jugador de la Liga Independiente Temporada 2009 estuvo muy reñida, al punto que hubo que hacer otra ronda de votación porque en la primera resultó empate. Participaron de la elección Edgar Fonseca (I.D.S.C.), Adrián Flores (Sportivo), Martín Mozzoni (Sportivo), Lucas Giménez (Vélez), Maxi Caffot (Juv. Católica), Cristian Durán (Atlético Calchín), Gabriel Rébola (Asoc. Colazo) y Exequiel Luján (Asoc. Colazo).
